Bos taurus Gene: ATG5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631895.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Autophagy protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000005400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Autophagy protein 5
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ATG5 forms a conjugate with ATG12 to directly associate with DDX58 and MAVS and negatively regulate the antiviral IFN production pathway by mediating autophagy.
[Homo sapiens] ATG12::ATG5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. ATG12::ATG5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
[Mus musculus] Atg12::Atg5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. Atg12::Atg5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
[Mus musculus] Atg5 knockout mice develop systemic and hepatic inflammation with high-fat diet and low-dose lipolysaccharide treatment.
[Mus musculus] Atg5 plays a unique role in protection against M. tuberculosis by preventing polymorphic mononuclear cell (PMN)-mediated immunopathology. Loss of Atg5 in PMNs can cause susceptibility to M. tuberculosis.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000057663:
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:44166445-44204874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 91 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Innate Immune System pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
Innate Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Immune System pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
Shigellosis pathway
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||