Bos taurus Gene: SNAPIN | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632741.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNAPIN | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SNARE-associated protein Snapin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000012470 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SNARE-associated protein Snapin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143553:
The protein encoded by this gene is a coiled-coil-forming protein that associates with the SNARE (soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein attachment protein receptor) complex of proteins and the BLOC-1 (biogenesis of lysosome-related organelles) complex. Biochemical studies have identified additional binding partners. As part of the SNARE complex, it is required for vesicle docking and fusion and regulates neurotransmitter release. The BLOC-1 complex is required for the biogenesis of specialized organelles such as melanosomes and platelet dense granules. Mutations in gene products that form the BLOC-1 complex have been identified in mouse strains that are models of Hermansky-Pudlak syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:16783420-16785104 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 63 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A4FUG0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 511816 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.61160 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083410 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | BC114837 DAAA02007184 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI14838 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 511816 | ||||||||||||||||||||||