Bos taurus Gene: BT.104940 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634926.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.104940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | hepatocyte nuclear factor 1-alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HNF-1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000021795 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Uncharacterized protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000135100:
The protein encoded by this gene is a transcription factor required for the expression of several liver-specific genes. The encoded protein functions as a homodimer and binds to the inverted palindrome 5'-GTTAATNATTAAC-3'. Defects in this gene are a cause of maturity onset diabetes of the young type 3 (MODY3) and also can result in the appearance of hepatic adenomas. [provided by RefSeq, Mar 2009] The protein encoded by this gene is a transcription factor required for the expression of several liver-specific genes. The encoded protein functions as a homodimer and binds to the inverted palindrome 5\'-GTTAATNATTAAC-3\'. Defects in this gene are a cause of maturity onset diabetes of the young type 3 (MODY3) and also can result in the appearance of hepatic adenomas. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:65417479-65434194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 217 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL6 pathway
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REACTOME |
Regulation of gene expression in beta cells pathway
Developmental Biology pathway
Regulation of beta-cell development pathway
Regulation of gene expression in beta cells pathway
Developmental Biology pathway
Regulation of beta-cell development pathway
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KEGG |
Maturity onset diabetes of the young pathway
Maturity onset diabetes of the young pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
Presenilin action in Notch and Wnt signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MD26 Q5DM49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 503578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.104940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY621540 DAAA02045462 DAAA02045463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAU95737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 503578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||