Bos taurus Gene: SSH1 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-635503.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SSH1 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000018825 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
slingshot homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000084112:
The protein encoded by this gene belongs to the slingshot homolog (SSH) family of phosphatases, which regulate actin filament dynamics. The SSH proteins dephosphorylate and activate the actin binding/depolymerizing factor cofilin, which subsequently binds to actin filaments and stimulates their disassembly. Cofilin is inactivated by kinases such as LIM domain kinase-1 (LIMK1), which may also be dephosphorylated and inactivated by SSH proteins. The SSH family thus appears to play a role in actin dynamics by reactivating cofilin proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:66389870-66434922 | ||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Regulation of actin cytoskeleton pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI |
CXCR4-mediated signaling events
FGF signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BIZ2 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 538233 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.25416 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002694601 XM_618431 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30579 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02045487 | ||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 538233 | ||||||||||||||||||||