Bos taurus Gene: ALKBH3 | |||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636865.3 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | ALKBH3 | ||||||||||||||||
Gene Name | Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3 | ||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000009518 | ||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000166199:
The Escherichia coli AlkB protein protects against the cytotoxicity of methylating agents by repair of the specific DNA lesions generated in single-stranded DNA. ALKBH2 (MIM 610602) and ALKBH3 are E. coli AlkB homologs that catalyze the removal of 1-methyladenine and 3-methylcytosine (Duncan et al., 2002 [PubMed 12486230]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:74847959-74889003 | ||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
ABH3 mediated Reversal of Alkylation Damage pathway
DNA Damage Reversal pathway
Reversal of Alkylation Damage By DNA Dioxygenases pathway
DNA Repair pathway
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KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
ABH3 mediated Reversal of Alkylation Damage pathway
DNA Damage Reversal pathway
Reversal of Alkylation Damage By DNA Dioxygenases pathway
DNA Repair pathway
Reversal of Alkylation Damage By DNA Dioxygenases pathway
ABH3 mediated Reversal of Alkylation Damage pathway
DNA Repair pathway
DNA Damage Reversal pathway
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KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | Q32L00 | ||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | 514579 | ||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037602 XM_005216455 XM_005216456 | ||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
EMBL | BC109832 | ||||||||||||||||
GenPept | AAI09833 | ||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 514579 | ||||||||||||||||