Bos taurus Gene: PHF8 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-637450.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF8 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000013289 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000172943:
The protein encoded by this gene is a histone lysine demethylase that preferentially acts on histones in the monomethyl or dimethyl states. The encoded protein requires Fe(2+) ion, 2-oxoglutarate, and oxygen for its catalytic activity. Defects in this gene are a cause of mental retardation syndromic X-linked Siderius type (MRXSSD). Four transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:96802567-96867773 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Chromatin organization pathway
HDMs demethylate histones pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Condensation of Prophase Chromosomes pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Mitotic Prophase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.52661 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002700122 XM_005228232 XM_005228236 XM_005228237 XM_872450 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||