Homo sapiens Gene: PHF8 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-70682.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF8 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 8 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | JHDM1F; MRXSSD; ZNF422 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000172943 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a histone lysine demethylase that preferentially acts on histones in the monomethyl or dimethyl states. The encoded protein requires Fe(2+) ion, 2-oxoglutarate, and oxygen for its catalytic activity. Defects in this gene are a cause of mental retardation syndromic X-linked Siderius type (MRXSSD). Four transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:53936676-54048958 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | p11.22 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 46 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.731707 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001184896 NM_001184897 NM_001184898 NM_015107 XM_005261996 XM_005261998 XM_005261999 XM_005262000 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14355 CCDS55418 CCDS55419 CCDS55420 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06599 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||