Bos taurus Gene: RBFOX2 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-637948.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBFOX2 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | RNA binding protein fox-1 homolog 2 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | RBM9 | ||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020125 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100320:
This gene is one of several human genes similar to the C. elegans gene Fox-1. This gene encodes an RNA binding protein that is thought to be a key regulator of alternative exon splicing in the nervous system and other cell types. The protein binds to a conserved UGCAUG element found downstream of many alternatively spliced exons and promotes inclusion of the alternative exon in mature transcripts. The protein also interacts with the estrogen receptor 1 transcription factor and regulates estrogen receptor 1 transcriptional activity. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:74257475-74473002 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 41 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N2A9 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 514951 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.3013 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205372 XM_005206787 XM_005206788 XM_005206791 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9906 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02013800 | ||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 514951 | ||||||||||||||||||||