Mus musculus Gene: Rbfox2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-157578.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbfox2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Fbm2; Fxh; Hrnbp2; Rbm9 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033565 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100320:
This gene is one of several human genes similar to the C. elegans gene Fox-1. This gene encodes an RNA binding protein that is thought to be a key regulator of alternative exon splicing in the nervous system and other cell types. The protein binds to a conserved UGCAUG element found downstream of many alternatively spliced exons and promotes inclusion of the alternative exon in mature transcripts. The protein also interacts with the estrogen receptor 1 transcription factor and regulates estrogen receptor 1 transcriptional activity. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:77078990-77307053 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.202774 Mm.397745 Mm.472147 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110827 NM_001110828 NM_001110829 NM_001110830 NM_001286418 NM_053104 NM_175387 XM_006521574 XM_006521576 XM_006521577 XM_006521580 XM_006521591 XM_006521592 XM_006521593 XM_006521596 XM_006521597 XM_006521598 XM_006521599 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27598 CCDS49657 CCDS49658 CCDS49659 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||