Bos taurus Gene: BT.21547 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-638338.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.21547 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | plakophilin-2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000002651 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
plakophilin-2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000057294:
This gene encodes a member of the arm-repeat (armadillo) and plakophilin gene families. Plakophilin proteins contain numerous armadillo repeats, localize to cell desmosomes and nuclei, and participate in linking cadherins to intermediate filaments in the cytoskeleton. This gene product may regulate the signaling activity of beta-catenin. Two alternately spliced transcripts encoding two protein isoforms have been identified. A processed pseudogene with high similarity to this locus has been mapped to chromosome 12p13. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:77370781-77452340 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.21547 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083729 XM_005206843 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||