Bos taurus Gene: BT.74188 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-638745.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.74188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | class E basic helix-loop-helix protein 41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BHLHB3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000030575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
basic helix-loop-helix domain containing, class B, 3
basic helix-loop-helix domain containing, class B, 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a basic helix-loop-helix protein expressed in various tissues. The encoded protein can interact with ARNTL or compete for E-box binding sites in the promoter of PER1 and repress CLOCK/ARNTL\'s transactivation of PER1. This gene is believed to be involved in the control of circadian rhythm and cell differentiation. Defects in this gene are associated with the short sleep phenotype. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:84233719-84236923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Bmal1:Clock,Npas2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
Circadian Clock pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-1-alpha transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BMV2 G3MYL5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 613907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.74188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02014030 DAAA02014031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 613907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||