Mus musculus Gene: Bhlhe41 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197884.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Bhlhe41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | basic helix-loop-helix family, member e41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6430520M22Rik; Bhlhb2l; Bhlhb3; DEC2; Sharp1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
basic helix-loop-helix family, member e41
basic helix-loop-helix family, member e41
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a class E basic helix-loop-helix type transcription factor. The encoded protein is a key regulator of the mammalian circadian clock. A dominant mutation in this gene results in a short sleep phenotype. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2012] This gene encodes a basic helix-loop-helix protein expressed in various tissues. The encoded protein can interact with Arntl or compete for E-box binding sites in the promoter of Per1 and repress Clock/Arntl\'s transactivation of Per1. This gene is believed to be involved in the control of circadian rhythm and cell differentiation. Defects in this gene are associated with the short sleep phenotype. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:145858243-145865558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Bmal1:Clock,Npas2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
Circadian Clock pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-1-alpha transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z2G6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 79362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.154529 Mm.396926 Mm.400172 Mm.407866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001271768 NM_024469 XM_006507013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS71860 CCDS20697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1930704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Bhlhe41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC144936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 79362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||