Bos taurus Gene: NR1D1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-639595.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NR1D1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000012178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a transcription factor that is a member of the nuclear receptor subfamily 1. The encoded protein is a ligand-sensitive transcription factor that negatively regulates the expression of core clock proteins. In particular this protein represses the circadian clock transcription factor aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1 (ARNTL). This protein may also be involved in regulating genes that function in metabolic, inflammatory and cardiovascular processes. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:41040926-41048228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Generic Transcription Pathway pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Gene Expression pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
Rora activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Circadian rhythm pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.112066 Bt.65340 Bt.89499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001078100 XM_005220769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||