Bos taurus Gene: BT.21158 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-643306.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.21158 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000016128 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000125447:
This gene encodes a member of the Golgi-localized, gamma adaptin ear-containing, ARF-binding (GGA) family. This family includes ubiquitous coat proteins that regulate the trafficking of proteins between the trans-Golgi network and the lysosome. These proteins share an amino-terminal VHS domain which mediates sorting of the mannose 6-phosphate receptors at the trans-Golgi network. They also contain a carboxy-terminal region with homology to the ear domain of gamma-adaptins. Multiple alternatively spliced transcript variants have been identified in this gene. [provided by RefSeq, Feb 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:56863207-56877029 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysosome pathway
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Arf1 pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G5E690 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 510539 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.21158 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083404 XM_005221179 XM_005221180 XM_005221181 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17079 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02049525 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 510539 | ||||||||||||||||||||||