Bos taurus Gene: PTPRM | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644257.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPRM | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000024015 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, receptor type, M
|
||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000173482:
The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and two tandem catalytic domains, and thus represents a receptor-type PTP. The extracellular region contains a meprin-A5 antigen-PTP mu (MAM) domain, an Ig-like domain and four fibronectin type III-like repeats. This PTP has been shown to mediate cell-cell aggregation through the interaction with another molecule of this PTP on an adjacent cell. This PTP can interact with scaffolding protein RACK1/GNB2L1, which may be necessary for the downstream signaling in response to cell-cell adhesion. Alternative splicing results in multiple transcripts encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 24:40768713-41437121 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Adherens junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Adherens junction pathway
|
||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nectin adhesion pathway
|
||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.109572 Bt.33524 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_005196751 XM_005224296 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||