Bos taurus Gene: LYN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644437.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LYN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tyrosine-protein kinase Lyn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Lyn/PI3K module negatively regulates activation of murine macrophages while Inpp5d (SHIP-1) promotes it.
[Mus musculus] Overexpression of Lyn results in endotoxin hypersensitivity due to the increased activation of dendritic cells leading to an over-production of Ifng by natural killer cells.
[Mus musculus] Lyn regulates the macrophage basal-state signalling checkpoint, and the signalling reorganization initiated by receptor clustering allows cells to discriminate optimally between pathogens and nonpathogens.
[Homo sapiens] The LYN/PI3K module negatively regulates activation of murine macrophages while Inpp5d (SHIP-1) promotes it.
[Homo sapiens] Overexpression of LYN results in endotoxin hypersensitivity due to the increased activation of dendritic cells leading to an over-production of IFNG by natural killer cells. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] LYN-dependent phosphorylation of the p110 catalytic subunit of PI 3-kinase is essential to the control of PI 3-kinase biological activity upstream of AKT and thereby to the transactivation of NFκB.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000254087:
This gene encodes a tyrosine protein kinase, which maybe involved in the regulation of mast cell degranulation, and erythroid differentiation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:24847257-24920713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 120 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
KitReceptor pathway
TCR pathway
BCR pathway
IL2 pathway
IL3 pathway
IL5 pathway
IL6 pathway
RANKL pathway
TSLP pathway
Prolactin pathway
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REACTOME |
Innate Immune System pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers pathway
Hemostasis pathway
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
FCERI mediated NF-kB activation pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
EPHA-mediated growth cone collapse pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
FCGR activation pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
CD28 co-stimulation pathway
Costimulation by the CD28 family pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Axon guidance pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
FCERI mediated Ca+2 mobilization pathway
Fcgamma receptor (FCGR) dependent phagocytosis pathway
CTLA4 inhibitory signaling pathway
Adaptive Immune System pathway
Developmental Biology pathway
Growth hormone receptor signaling pathway
Signal Transduction pathway
FCERI mediated MAPK activation pathway
FCGR activation pathway
Growth hormone receptor signaling pathway
Regulation of signaling by CBL pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
CTLA4 inhibitory signaling pathway
CD28 co-stimulation pathway
Costimulation by the CD28 family pathway
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers pathway
PECAM1 interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Developmental Biology pathway
FCERI mediated NF-kB activation pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Axon guidance pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Signal Transduction pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
EPHA-mediated growth cone collapse pathway
Signaling by Interleukins pathway
Fcgamma receptor (FCGR) dependent phagocytosis pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
FCERI mediated Ca+2 mobilization pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
FCERI mediated MAPK activation pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Long-term depression pathway
B cell receptor signaling pathway pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection pathway
B cell receptor signaling pathway pathway
Long-term depression pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
LPA receptor mediated events
EPO signaling pathway
BCR signaling pathway
Signaling events mediated by Stem cell factor receptor (c-Kit)
GMCSF-mediated signaling events
Fc-epsilon receptor I signaling in mast cells
IL5-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 534996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.53847 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001177740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02038326 DAAA02038327 DAAA02038328 DAAA02038329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 534996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||