Bos taurus Gene: TCF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-645672.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TCF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor E2-alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TCF7L1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000008695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000071564:
This gene encodes a member of the E protein (class I) family of helix-loop-helix transcription factors. E proteins activate transcription by binding to regulatory E-box sequences on target genes as heterodimers or homodimers, and are inhibited by heterodimerization with inhibitor of DNA-binding (class IV) helix-loop-helix proteins. E proteins play a critical role in lymphopoiesis, and the encoded protein is required for B and T lymphocyte development. Deletion of this gene or diminished activity of the encoded protein may play a role in lymphoid malignancies. This gene is also involved in several chromosomal translocations that are associated with lymphoid malignancies including pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia (t(1;19), with PBX1), childhood leukemia (t(19;19), with TFPT) and acute leukemia (t(12;19), with ZNF384). Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the short arm of chromosome 9. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:45599593-45630734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 212 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
ID pathway
Wnt pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
Myogenesis pathway
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Notch-mediated HES/HEY network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
p38 signaling mediated by MAPKAP kinases
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MVI6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 530616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.3789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192698 XM_005209298 XM_005209299 XM_005209300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02020273 DAAA02020274 DAAA02020275 DAAA02020276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 530616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||