Bos taurus Gene: SEC61A1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646508.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEC61A1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000004937 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000058262:
The protein encoded by this gene belongs to the SECY/SEC61- alpha family. It appears to play a crucial role in the insertion of secretory and membrane polypeptides into the endoplasmic reticulum. This protein found to be tightly associated with membrane-bound ribosomes, either directly or through adaptor proteins. This gene encodes an alpha subunit of the heteromeric SEC61 complex, which also contains beta and gamma subunits. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:60217808-60229341 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ER-Phagosome pathway pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Gene Expression pathway
Immune System pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Adaptive Immune System pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ER-Phagosome pathway pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Translation pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Metabolism of proteins pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Gene Expression pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Translation pathway
Immune System pathway
Metabolism of proteins pathway
ER-Phagosome pathway pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Gene Expression pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG |
Vibrio cholerae infection pathway
Protein export pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
Phagosome pathway
Protein export pathway
Phagosome pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.21836 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001040504 XM_005223160 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||