Homo sapiens Gene: RPS3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-64727.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPS3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein S3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | S3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000149273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
ribosomal protein S3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 40S subunit, where it forms part of the domain where translation is initiated. The protein belongs to the S3P family of ribosomal proteins. Studies of the mouse and rat proteins have demonstrated that the protein has an extraribosomal role as an endonuclease involved in the repair of UV-induced DNA damage. The protein appears to be located in both the cytoplasm and nucleus but not in the nucleolus. Higher levels of expression of this gene in colon adenocarcinomas and adenomatous polyps compared to adjacent normal colonic mucosa have been observed. This gene is co-transcribed with the small nucleolar RNA genes U15A and U15B, which are located in its first and fifth introns, respectively. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:75399486-75422280 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 226 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Translation initiation complex formation pathway
Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex pathway
Ribosomal scanning and start codon recognition pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Ribosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YCJ7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.609293 Hs.617361 Hs.718347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001005 NM_001256802 NM_001260506 NM_001260507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS58161 CCDS8236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 10941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AP000744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||