Homo sapiens Gene: TSN | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68565.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TSN | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | translin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BCLF-1; C3PO; RCHF1; REHF-1; TBRBP; TRSLN | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000211460 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
translin
translin
translin
translin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a DNA-binding protein which specifically recognizes conserved target sequences at the breakpoint junction of chromosomal translocations. Translin polypeptides form a multimeric structure that is responsible for its DNA-binding activity. Recombination-associated motifs and translin-binding sites are present at recombination hotspots and may serve as indicators of breakpoints in genes which are fused by translocations. These binding activities may play a crucial role in chromosomal translocation in lymphoid neoplasms. This protein encoded by this gene, when complexed with translin-associated protein X, also forms a Mg ion-dependent endoribonuclease that promotes RNA-induced silencing complex (RISC) activation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:121737103-121767853 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q14.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis pathway
Gene Expression pathway
Regulatory RNA pathways pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.75066 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001261401 NM_004622 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33284 CCDS58723 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 08993 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||