Mus musculus Gene: Hmgcs1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-704205.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hmgcs1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000093930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000112972:
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:119690462-119708086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D2.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
PPARA activates gene expression pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Synthesis and degradation of ketone bodies pathway
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
Butanoate metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Butanoate metabolism pathway
Synthesis and degradation of ketone bodies pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
Butanoate metabolism pathway
Valine Leucine Isoleucine degradation pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8JZK9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 208715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.470344 Mm.470503 Mm.61526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001291439 NM_145942 XM_006517576 XM_006517577 XM_006517578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Hmgcs1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK031297 AK044835 AK045094 AK135551 BC023851 BC029693 BC034317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH23851 AAH29693 AAH34317 BAC27338 BAC32112 BAC32218 BAE22579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 208715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||