Homo sapiens Gene: HMGCS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19361.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HMGCS1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HMGCS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000112972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble)
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble)
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:43289395-43313512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Bos taurus
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Cholesterol biosynthesis pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Terpenoid backbone biosynthesis pathway
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Butanoate metabolism pathway
Synthesis and degradation of ketone bodies pathway
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INOH |
Butanoate metabolism pathway
Valine Leucine Isoleucine degradation pathway
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PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RIW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.397729 Hs.602526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001098272 NM_002130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 142940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC114947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||