Homo sapiens Gene: RPN2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-73849.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPN2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribophorin II | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RIBIIR; RPN-II; RPNII; SWP1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000118705 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribophorin II
ribophorin II
ribophorin II
ribophorin II
ribophorin II
ribophorin II
ribophorin II
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a type I integral membrane protein found only in the rough endoplasmic reticulum. The encoded protein is part of an N-oligosaccharyl transferase complex that links high mannose oligosaccharides to asparagine residues found in the Asn-X-Ser/Thr consensus motif of nascent polypeptide chains. This protein is similar in sequence to the yeast oligosaccharyl transferase subunit SWP1. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:37178410-37241623 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q11.23 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 44 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Asparagine N-linked glycosylation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Post-translational protein modification pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
N-Glycan biosynthesis pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.370895 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001135771 NM_002951 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13291 CCDS46599 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01609 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||