Homo sapiens Gene: PHF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82785.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | hPHF1; MTF2L2; PCL1; PHF2; TDRD19C | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000112511 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
PHD finger protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a Polycomb group protein. The protein is a component of a histone H3 lysine-27 (H3K27)-specific methyltransferase complex, and functions in transcriptional repression of homeotic genes. The protein is also recruited to double-strand breaks, and reduced protein levels results in X-ray sensitivity and increased homologous recombination. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:33410399-33416453 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.32 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.166204 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002636 NM_024165 XM_006715109 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4777 CCDS4778 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04195 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||