Homo sapiens Gene: ATG4B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-85252.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG4B | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 4B, cysteine peptidase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | APG4B; AUTL1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168397 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Autophagy is the process by which endogenous proteins and damaged organelles are destroyed intracellularly. Autophagy is postulated to be essential for cell homeostasis and cell remodeling during differentiation, metamorphosis, non-apoptotic cell death, and aging. Reduced levels of autophagy have been described in some malignant tumors, and a role for autophagy in controlling the unregulated cell growth linked to cancer has been proposed. This gene encodes a member of the autophagin protein family. The encoded protein is also designated as a member of the C-54 family of cysteine proteases. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:241637213-241673857 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q37.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 39 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.283610 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_013325 NM_178326 XM_005246993 XM_005246996 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46564 CCDS46565 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16499 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||