Homo sapiens Gene: MATN1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95361.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MATN1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | matrilin 1, cartilage matrix protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CMP; CRTM | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000162510 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
matrilin 1, cartilage matrix protein
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of von Willebrand factor A domain containing protein family. This family of proteins are thought to be involved in the formation of filamentous networks in the extracellular matrices of various tissues. Mutations of this gene have been associated with variety of inherited chondrodysplasias. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:30711277-30723587 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p35.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P21941 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4146 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.150366 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002379 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6907 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 115437 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS336 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK312949 AL137857 M55675 M55676 M55677 M55679 M55680 M55681 M55682 M55683 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA63904 AAB38702 BAG35790 CAI19322 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4146 | ||||||||||||||||||||||