Homo sapiens Gene: TRDN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96065.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRDN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | triadin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CPVT5; TDN; TRISK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000186439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
triadin
triadin
triadin
triadin
triadin
triadin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an integral membrane protein that contains a single transmembrane domain. As similar protein in rabbits plays a role in skeletal muscle excitation-contraction coupling as part of the calcium release complex in association with the ryanodine receptor. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and single nucleotide polymorphisms in this gene may be markers for IgA nephritis. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:123216339-123637093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H9ME53 Q5SWK9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.144744 Hs.720730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001256020 NM_001256021 NM_001256022 NM_006073 XM_006715301 XM_006715302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59035 CCDS75511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL133257 AL357352 AL445259 AL603902 AL603911 BC070290 BC139910 JN900469 U18985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA75315 AAH70290 AAI39911 AEW10557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||