Homo sapiens Gene: VNN2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96680.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | VNN2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | vanin 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | FOAP-4; GPI-80 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000112303 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vanin 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene product is a member of the Vanin family of proteins that share extensive sequence similarity with each other, and also with biotinidase. The family includes secreted and membrane-associated proteins, a few of which have been reported to participate in hematopoietic cell trafficking. No biotinidase activity has been demonstrated for any of the vanin proteins, however, they possess pantetheinase activity, which may play a role in oxidative-stress response. The encoded protein is a GPI-anchored cell surface molecule that plays a role in transendothelial migration of neutrophils. This gene lies in close proximity to, and in same transcriptional orientation as two other vanin genes on chromosome 6q23-q24. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:132743870-132763459 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q23.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Pantothenate and CoA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PRD9 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8875 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.293130 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001242350 NM_004665 NM_078488 XM_006715593 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12706 | ||||||||||||||||||
OMIM | 603571 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5161 CCDS5162 CCDS56451 | ||||||||||||||||||
HPRD | 04652 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AL032821 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8875 | ||||||||||||||||||