Homo sapiens Protein: RC3H1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-104924.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RC3H1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | ring finger and CCCH-type domains 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000356669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104922 (RC3H1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Post-transcriptional repressor of mRNAs containing a conserved stem loop motif, called constitutive decay element (CDE), which is often located in the 3'-UTR, as in HMGXB3, ICOS, IER3, NFKBID, NFKBIZ, PPP1R10, TNF and in many more mRNAs (By similarity). Binds to CDE and promotes mRNA deadenylation and degradation. This process does not involve miRNAs (By similarity). In follicular helper T (Tfh) cells, represses of ICOS and TNFRSF4 expression, thus preventing spontaneous Tfh cell differentiation, germinal center B-cell differentiation in the absence of immunization and autoimmunity (By similarity). In resting or LPS- stimulated macrophages, controls inflammation by suppressing TNF expression (By similarity). Also recognizes CDE in its own mRNA and in that of paralogous RC3H2, possibly leading to feedback loop regulation (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body {ECO:0000250}. Note=During stress, such as that induced by arsenite, localizes to cytosolic stress granules. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Expressed at higher level in cerebellum, spleen, ovary and liver. {ECO:0000269Ref.3}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000571
Zinc finger, CCCH-type IPR001841 Zinc finger, RING-type |
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PFAM |
PF00642
PF13639 PF14634 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00356
SM00184 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5TC82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5TC82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B9EGU6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 149041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.624605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001287779 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 609424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 13913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB095945 AK093501 AK122948 AL121983 AL136170 BC136784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI36785 BAC04186 BAC23121 BAG53813 CAH70709 CAH70710 CAI19417 CAI19419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||