Homo sapiens Protein: TNR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-104983.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tenascin R (restrictin, janusin) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TN-R; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000356646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104981 (TNR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Neural extracellular matrix (ECM) protein involved in interactions with different cells and matrix components. These interactions can influence cellular behavior by either evoking a stable adhesion and differentiation, or repulsion and inhibition of neurite growth. Binding to cell surface gangliosides inhibits RGD-dependent integrin-mediated cell adhesion and results in an inhibition of PTK2/FAK1 (FAK) phosphorylation and cell detachment. Binding to membrane surface sulfatides results in a oligodendrocyte adhesion and differentiation. Interaction with CNTN1 induces a repulsion of neurons and an inhibition of neurite outgrowth. Interacts with SCN2B may play a crucial role in clustering and regulation of activity of sodium channels at nodes of Ranvier. TNR-linked chondroitin sulfate glycosaminoglycans are involved in the interaction with FN1 and mediate inhibition of cell adhesion and neurite outgrowth. The highly regulated addition of sulfated carbohydrate structure may modulate the adhesive properties of TNR over the course of development and during synapse maintenance (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain specific. {ECO:0000269PubMed:8626505}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR003961 Fibronectin, type III IPR013111 EGF-like domain, extracellular |
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PFAM |
PF00008
PF00147 PF00041 PF01108 PF07974 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00186 SM00060 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A1L306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.659864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL021919 AL023285 AL136530 BC129830 X98085 Z67996 Z94055 Z94057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI29831 CAA66709 CAA91947 CAI19943 CAI21650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||