Mus musculus Protein: Colec12 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-128249.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Colec12 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | collectin sub-family member 12 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000043220 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-128247 (Colec12) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Scavenger receptor that displays several functions associated with host defense. Promotes binding and phagocytosis of Gram-positive, Gram-negative bacteria and yeast. Binds also to sialyl Lewis X or a trisaccharide and asialo-orosomucoid (ASOR). Mediates the recognition, internalization and degradation of oxidatively modified low density lipoprotein (oxLDL) by vascular endothelial cells (By similarity). Binds to several carbohydrates including Gal-type ligands, D-galactose, L- and D-fucose, GalNAc, T and Tn antigens in a calcium-dependent manner and internalizes specifically GalNAc in nurse-like cells (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000250}; Single-pass type II membrane protein {ECO:0000250}. Note=Forms clusters on the cell surface. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in vascular endothelial cells in the heart, in perivascular macrophage and smooth muscle cells. Expressed in plaques-surrounding reactive astrocytes located in cerebral cortex and hippocampus and in leptomeningeal vessels showing characteristics of cerebral amyloid angiopathy (CAA) in a double transgenic mouse model of Alzheimer disease (at protein level). Strongly expressed in lung. Moderately expressed in heart, skeletal muscle, spleen, liver, brain, colon, testis, stomach and kidney. Expressed in neonatal astrocytes. Expressed in reactive astrocytes and vascular/perivascular cells in the brain of a double transgenic mouse model of Alzheimer disease. {ECO:0000269PubMed:11564734, ECO:0000269PubMed:11718900, ECO:0000269PubMed:16868960}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2152907 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001304
C-type lectin IPR002353 Type-2 ice-structuring protein IPR008160 Collagen triple helix repeat IPR016187 C-type lectin fold |
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PFAM |
PF00059
PF01391 |
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PRINTS |
PR00356
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00034
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8K4Q8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8K4Q8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 140792 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.419536 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_569716 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2OX9 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Colec12 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37732 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB038519 AB078434 AK042772 AK158366 BC057936 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH57936 BAB82497 BAC05523 BAC31361 BAE34474 | ||||||||||||||||||||||