Mus musculus Protein: Rbfox1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-131281.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbfox1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000049970 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131279 (Rbfox1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that regulates alternative splicing events by binding to 5'-UGCAUGU-3' elements. Prevents binding of U2AF2 to the 3'-splice site. Regulates alternative splicing of tissue-specific exons and of differentially spliced exons during erythropoiesis. {ECO:0000269PubMed:12574126, ECO:0000269PubMed:15824060, ECO:0000269PubMed:16260614, ECO:0000269PubMed:17101796}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Note=Predominantly nuclear. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in brain (at protein level). Detected in heart, brain, neurons, skeletal muscle and embryo. {ECO:0000269PubMed:12574126, ECO:0000269PubMed:15824060, ECO:0000269PubMed:16260614}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1926224 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR017325 RNA binding protein Fox-1 IPR025670 Fox-1 C-terminal domain |
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PFAM |
PF00076
PF12414 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037932
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SMART |
SM00360
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JJ43 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9JJ43 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 268859 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.398989 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_899011 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rbfox1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27936 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB041596 AF107204 AF191501 AK134833 AY659954 AY659955 AY659956 AY659957 AY659958 BC059002 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF78292 AAH59002 AAL83425 AAV74337 AAV74338 AAV74339 AAV74340 AAV74341 BAA95079 BAE22304 | ||||||||||||||||||||||