Mus musculus Gene: Rbfox1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131279.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbfox1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000008658 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1
RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000078328:
The Fox-1 family of RNA-binding proteins is evolutionarily conserved, and regulates tissue-specific alternative splicing in metazoa. Fox-1 recognizes a (U)GCAUG stretch in regulated exons or in flanking introns. The protein binds to the C-terminus of ataxin-2 and may contribute to the restricted pathology of spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2). Ataxin-2 is the product of the SCA2 gene which causes familial neurodegenerative diseases. Fox-1 and ataxin-2 are both localized in the trans-Golgi network. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:6809222-7412479 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Bmal1:Clock,Npas2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.395256 Mm.398989 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021477 NM_183188 XM_006522159 XM_006522182 XM_006522188 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27936 CCDS37245 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||