Mus musculus Protein: Shprh | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-133392.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Shprh | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SNF2 histone linker PHD RING helicase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000039422 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-488459 (Shprh) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase involved in DNA repair. Upon genotoxic stress, accepts ubiquitin from the UBE2N-UBE2V2 E2 complex and transfers it to 'Lys-164' of PCNA which had been monoubiquitinated by UBE2A/B-RAD18, promoting the formation of non-canonical poly-ubiquitin chains linked through 'Lys-63' (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Broadly expressed (at protein level). {ECO:0000269PubMed:12837266}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1917581 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR001202 WW domain IPR001251 CRAL-TRIO domain IPR001650 Helicase, C-terminal IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR005818 Linker histone H1/H5, domain H15 IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00176
PF00397 PF00650 PF13716 PF00271 PF13639 PF14634 PF00538 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00456
SM00516 SM00490 SM00184 SM00249 SM00526 SM00487 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q7TPQ3 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q7TPQ3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 268281 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.461266 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001071175 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Shprh | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35838 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK053448 AK082160 AY162264 AY162265 AY162266 BC006883 BC055003 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH06883 AAH55003 AAO26654 AAO26655 AAO26656 BAC35389 BAC38428 | ||||||||||||||||||||||