Mus musculus Protein: Fxr1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-137737.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Fxr1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110050J02Rik; 9530073J07Rik; AI851072; Fxr1h; Fxr1p; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000001620 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-137735 (Fxr1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein required for embryonic and postnatal development of muscle tissue. May regulate intracellular transport and local translation of certain mRNAs. {ECO:0000269PubMed:15128702}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | In early embryogenesis, highest expression in somites and central nervous system. Also expressed in spinal cord, surrounding mesenchymal tissue and undifferentiated gonad. In mid- embryogenesis, most prominent in gonad and muscle tissue. Also expressed in liver, retina, telencephalon and mesencephalon. In late embryogenesis, restricted to skeletal muscle and proliferative active layers of brain. After birth, highly expressed in postmeiotic spermatids. Intermediate levels are found in heart, liver and kidney with lower levels in brain and skeletal muscle. Isoform(s) containing the 27 amino acid pocket (residues 564-590) are present in adult heart and muscle. {ECO:0000269PubMed:10409431, ECO:0000269PubMed:16000371}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:104860 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004087
K Homology domain IPR004088 K Homology domain, type 1 IPR008395 Agenet-like domain IPR012340 Nucleic acid-binding, OB-fold IPR022034 Fragile X mental retardation protein family |
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PFAM |
PF00013
PF13014 PF05641 PF12235 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00322
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61584 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q61584 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14359 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001106660 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Fxr1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50891 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF124385 AF124386 AF124387 AF124388 AF124389 AF124390 AF124391 AF124392 AF124393 AF124394 BC019139 X90875 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD30211 AAD30212 AAD30213 AAD30214 AAD30215 AAD30216 AAD30217 AAD30218 AAH19139 CAA62383 | ||||||||||||||||||||||