Mus musculus Gene: Fxr1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-137735.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Fxr1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110050J02Rik; 9530073J07Rik; AI851072; Fxr1h; Fxr1p | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027680 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog
fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] FXR1 is an essential component of a network of nuclear receptors that regulate intestinal innate immunity and homeostasis.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000114416:
The protein encoded by this gene is an RNA binding protein that interacts with the functionally-similar proteins FMR1 and FXR2. These proteins shuttle between the nucleus and cytoplasm and associate with polyribosomes, predominantly with the 60S ribosomal subunit. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:34020079-34069342 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61584 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8C7U4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14359 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001113188 NM_001113189 NM_008053 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50890 CCDS50891 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104860 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Fxr1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF124385 AF124386 AF124387 AF124388 AF124389 AF124390 AF124391 AF124392 AF124393 AF124394 AK049231 BC019139 X90875 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD30211 AAD30212 AAD30213 AAD30214 AAD30215 AAD30216 AAD30217 AAD30218 AAH19139 BAC33624 CAA62383 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 14359 | ||||||||||||||||||||||