Mus musculus Protein: Nxf1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-140747.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nxf1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | nuclear RNA export factor 1 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610006I08Rik; Mex67; Mvb1; Tap; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000010241 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140745 (Nxf1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the nuclear export of mRNA species bearing retroviral constitutive transport elements (CTE) and in the export of mRNA from the nucleus to the cytoplasm (TAP/NFX1 pathway). The NXF1-NXT1 heterodimer is involved in the export of HSP70 mRNA in conjunction with ALYREF/THOC4 and THOC5 components of the TREX complex (By similaity). ALYREF/THOC4- or Alyref2/Refbp2-bound mRNA is thought to be transferred to the NXF1-NXT1 heterodimer for export. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00611}. Cytoplasm {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00611}. Note=Localized predominantly in the nucleoplasm and at both the nucleoplasmic and cytoplasmic faces of the nuclear pore complex. Shuttles between the nucleus and the cytoplasm. Travels to the cytoplasm as part of the exon junction complex (EJC) bound to mRNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed ubiquitously. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 86 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1858330 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002075
Nuclear transport factor 2 IPR005637 TAP C-terminal (TAP-C) domain IPR009060 UBA-like IPR015245 Nuclear RNA export factor Tap, RNA-binding domain IPR018222 Nuclear transport factor 2, eukaryote |
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PFAM |
PF02136
PF03943 PF09162 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00804
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99JX7 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99JX7 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 66836 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.403900 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_058093 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nxf1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29543 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF093140 AK133883 AK167518 BC005594 CH466612 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC63368 AAH05594 BAE21911 BAE39590 EDL33363 | ||||||||||||||||||||||