Mus musculus Protein: Polb | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-140911.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Polb | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | polymerase (DNA directed), beta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A430088C08Rik; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000033938 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140909 (Polb) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Repair polymerase that plays a key role in base-excision repair. Has 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase (dRP lyase) activity that removes the 5' sugar phosphate and also acts as a DNA polymerase that adds one nucleotide to the 3' end of the arising single-nucleotide gap. Conducts 'gap-filling' DNA synthesis in a stepwise distributive fashion rather than in a processive fashion as for other DNA polymerases (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Note=Cytoplasmic in normal conditions. Translocates to the nucleus following DNA damage (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97740 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002008
DNA polymerase, family X, beta-like IPR002054 DNA-directed DNA polymerase X IPR003583 Helix-hairpin-helix DNA-binding motif, class 1 IPR010996 DNA polymerase beta-like, N-terminal domain IPR018944 DNA polymerase lambda, fingers domain IPR022312 DNA polymerase family X |
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PFAM |
PF10391
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PRINTS |
PR00870
PR00869 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00483
SM00278 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8K409 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8K409 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q62085 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18970 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.123211 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035260 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Polb | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22181 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF513911 AK077127 AK146745 AK151436 BC006681 BC060998 M16363 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39959 AAH06681 AAH60998 AAM49616 BAC36630 BAE27405 BAE30399 | ||||||||||||||||||||||