Mus musculus Protein: Trpc4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-144334.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trpc4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCE1; STRPC4; Trp4; Trrp4; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000029311 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-144332 (Trpc4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Thought to form a receptor-activated non-selective calcium permeant cation channel. Probably is operated by a phosphatidylinositol second messenger system activated by receptor tyrosine kinases or G-protein coupled receptors. Acts as a cell- cell contact-dependent endothelial calcium entry channel. Has also been shown to be calcium-selective (By similarity). May also be activated by intracellular calcium store depletion. Trpc4 deficient mice lack a store-operated calcium entry in endothelial cells. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:11175743}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000305}. Cell membrane {ECO:0000250}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Abundantly expressed in brain (hippocampal CA1 pyramidal neurons, dentate gyrus granule cells, and cerebral cortical neurons, and in the septal nuclei and the mitral layer of olfactory bulb). Lower levels are detected in other tissues. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109525 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002110
Ankyrin repeat IPR002153 Transient receptor potential channel, canonical IPR004729 Transient receptor potential channel IPR005460 Transient receptor potential channel, canonical 4 IPR005821 Ion transport domain IPR013555 Transient receptor ion channel domain IPR020683 Ankyrin repeat-containing domain |
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PFAM |
PF00023
PF13606 PF00520 PF08344 PF11929 PF12796 |
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PRINTS |
PR01415
PR01097 PR01645 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00248
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9QUQ5 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9QUQ5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q0VB97 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22066 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.10100 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_058680 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trpc4 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17350 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF011543 AF019663 AF190646 BC120729 BC131915 CH466530 U50921 U50922 X90697 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC05178 AAC05179 AAD10167 AAD10168 AAF01469 AAI20730 AAI31916 CAA62230 EDL35256 | ||||||||||||||||||||||