Homo sapiens Protein: CHD4 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-14536.5 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000349508 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14532 (CHD4) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Component of the histone deacetylase NuRD complex which participates in the remodeling of chromatin by deacetylating histones. {ECO:0000269PubMed:17626165, ECO:0000269PubMed:9804427}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17626165}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000269PubMed:17626165}. Note=Associates with centrosomes in interphase. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 115 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR000953 Chromo domain/shadow IPR001650 Helicase, C-terminal IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR009057 Homeodomain-like IPR009071 High mobility group box domain IPR009462 Domain of unknown function DUF1086 IPR009463 Domain of unknown function DUF1087 IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR012957 CHD, C-terminal 2 IPR012958 CHD, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR016197 Chromo domain-like IPR019787 Zinc finger, PHD-finger IPR021006 Histone deacetylase complex, subunit 2/3 IPR023780 Chromo domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00176
PF00271 PF04851 PF00505 PF09011 PF06461 PF06465 PF08074 PF08073 PF00628 PF11496 PF00385 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00298
SM00490 SM00249 SM00398 SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H6N4 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1108 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.605320 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001264 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1919 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603277 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8552 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04472 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006064 BC038596 X86691 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH38596 CAA60384 | ||||||||||||||||||||||||||||