Mus musculus Protein: Atg12 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-145434.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atg12 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | autophagy-related 12 (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4931423H11Rik; A330058M13Rik; Apg12l; Atg12l; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000038489 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145432 (Atg12) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like protein involved in autophagy vesicles formation. Conjugation with ATG5 through a ubiquitin-like conjugating system involving also ATG7 as an E1-like activating enzyme and ATG10 as an E2-like conjugating enzyme, is essential for its function. The ATG12-ATG5 conjugate acts as an E3-like enzyme which is required for lipidation of ATG8 family proteins and their association to the vesicle membranes. The ATG12-ATG5 conjugate also regulates negatively the innate antiviral immune response by blocking the type I IFN production pathway through direct association with RARRES3 and MAVS. Plays also a role in translation or delivery of incoming viral RNA to the translation apparatus. {ECO:0000269PubMed:11266458, ECO:0000269PubMed:12890687, ECO:0000269PubMed:20723759}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Preautophagosomal structure membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}. Note=TECPR1 recruits the ATG12-ATG5 conjugate to the autolysosomal membrane. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 65 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914776 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9CQY1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9CQY1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67526 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.9852 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080493 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Atg12 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37811 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB066216 AK005405 AK008698 AK016474 AK167027 BC070470 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH70470 BAB24005 BAB25839 BAB30256 BAB62092 BAE39200 | ||||||||||||||||||||||