Mus musculus Protein: Ddx56 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-146552.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx56 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2600001H07Rik; D11Ertd619e; Noh61; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000004507 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-146550 (Ddx56) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May play a role in later stages of the processing of the pre-ribosomal particles leading to mature 60S ribosomal subunits. Has intrinsic ATPase activity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 47 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1277172 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF04851 PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9D0R4 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9D0R4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SVX3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 52513 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.475354 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080814 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ddx56 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24414 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK011136 AK076975 AK077514 AK145628 AK159793 AK169654 BC018291 CH466574 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH18291 BAB27426 BAC36543 BAC36839 BAE26549 BAE35375 BAE41278 EDL40578 | ||||||||||||||||||||||