Mus musculus Protein: Ephb3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-146615.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ephb3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Eph receptor B3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AW456895; Cek10; Etk2; HEK2; MDK5; Sek4; Tyro6; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000006112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-146613 (Ephb3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor tyrosine kinase which binds promiscuously transmembrane ephrin-B family ligands residing on adjacent cells, leading to contact-dependent bidirectional signaling into neighboring cells. The signaling pathway downstream of the receptor is referred to as forward signaling while the signaling pathway downstream of the ephrin ligand is referred to as reverse signaling. Generally has an overlapping and redundant function with EPHB2. Like EPHB2, functions in axon guidance during development regulating for instance the neurons forming the corpus callosum and the anterior commissure, 2 major interhemispheric connections between the temporal lobes of the cerebral cortex. In addition to its role in axon guidance plays also an important redundant role with other ephrin-B receptors in development and maturation of dendritic spines and the formation of excitatory synapses. Controls other aspects of development through regulation of cell migration and positioning. This includes angiogenesis, palate development and thymic epithelium development for instance. Forward and reverse signaling through the EFNB2/EPHB3 complex also regulate migration and adhesion of cells that tubularize the urethra and septate the cloaca. Finally, plays an important role in intestinal epithelium differentiation segregating progenitor from differentiated cells in the crypt. {ECO:0000269PubMed:12408869, ECO:0000269PubMed:14691139, ECO:0000269PubMed:15223334, ECO:0000269PubMed:19598115, ECO:0000269PubMed:8947026, ECO:0000269PubMed:9990854}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:14691139}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:14691139}. Cell projection, dendrite {ECO:0000269PubMed:14691139}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in cells of the retinal ganglion cell layer during retinal axon guidance to the optic disk. Expressed by Paneth and progenitor cells in the crypts of the intestinal epithelium (at protein level). {ECO:0000269PubMed:10704386, ECO:0000269PubMed:12408869}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:104770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001090 Ephrin receptor ligand binding domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR001660 Sterile alpha motif domain IPR002290 Serine/threonine- /dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003961 Fibronectin, type III IPR008979 Galactose-binding domain-like IPR009030 Insulin-like growth factor binding protein, N-terminal IPR011009 Protein kinase-like domain IPR011510 Sterile alpha motif, type 2 IPR011641 Tyrosine-protein kinase ephrin type A/B receptor-like IPR013761 Sterile alpha motif/pointed domain IPR016257 Ephrin receptor type-A /type-B IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain IPR021129 Sterile alpha motif, type 1 |
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PFAM |
PF00069
PF01404 PF07714 PF00041 PF01108 PF07647 PF07699 PF00536 |
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PRINTS |
PR00109
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PIRSF |
PIRSF000666
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SMART |
SM00615
SM00454 SM00220 SM00060 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P54754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P54754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.6972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_034273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ephb3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC014822 BC053085 X76012 Z49086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH14822 AAH53085 CAA53599 CAA88910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||