Mus musculus Protein: Wrn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-147035.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Wrn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Werner syndrome homolog (human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI846146; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000033990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147033 (Wrn) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Multifunctional enzyme that has both magnesium and ATP- dependent DNA-helicase activity and 3'->5' exonuclease activity towards double-stranded DNA with a 5'-overhang. Has no nuclease activity towards single-stranded DNA or blunt-ended double- stranded DNA. Binds preferentially to DNA substrates containing alternate secondary structures, such as replication forks and Holliday junctions. May play an important role in the dissociation of joint DNA molecules that can arise as products of homologous recombination, at stalled replication forks or during DNA repair. Alleviates stalling of DNA polymerases at the site of DNA lesions. Important for genomic integrity. Plays a role in the formation of DNA replication focal centers; stably associates with foci elements generating binding sites for RP-A (By similarity). Plays a role in double-strand break repair after gamma-irradiation (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:9618508}. Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Note=Gamma-irradiation leads to its translocation from nucleoli to nucleoplasm and PML regulates the irradiation- induced WRN relocation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed ubiquitously in most organs at a low level, highly expressed in testis, ovary and spleen. {ECO:0000269PubMed:10757812, ECO:0000269PubMed:9143515}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109635 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR002121 HRDC domain IPR002562 3\'-5\' exonuclease domain IPR004589 DNA helicase, ATP-dependent, RecQ type IPR010997 HRDC-like IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR018982 RQC domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00570 PF01612 PF00270 PF09382 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00341 SM00474 SM00487 SM00956 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O09053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O09053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BWH5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.422146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2E6M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Wrn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC115809 AC153789 AF091215 AF091216 AF241636 AK052466 AK171490 BC050921 BC060700 D86526 D86527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC72359 AAC78077 AAF64490 AAH50921 AAH60700 BAA20269 BAA20270 BAC35005 BAE42489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||