Mus musculus Protein: Syne2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-149686.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syne2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | synaptic nuclear envelope 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000047697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-149682 (Syne2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Multi-isomeric modular protein which forms a linking network between organelles and the actin cytoskeleton to maintain the subcellular spatial organization. Component of SUN-protein- containing multivariate complexes also called LINC complexes which link the nucleoskeleton and cytoskeleton by providing versatile outer nuclear membrane attachment sites for cytoskeletal filaments. Involved in the maintenance of nuclear organization and structural integrity. Probable anchoring protein which tethers the nucleus to the cytoskeleton. Connects nuclei to the cytoskeleton by interacting with the nuclear envelope and with F-actin in the cytoplasm. Specifically, Syne2 and Sun2 assemble in arrays of transmembrane actin-associated nuclear (TAN) lines which are bound to F-actin cables and couple the nucleus to retrograde actin flow during actin-dependent nuclear movement. Required for centrosome migration to the apical cell surface during early ciliogenesis. {ECO:0000269PubMed:18477613, ECO:0000269PubMed:19596800, ECO:0000269PubMed:20724637}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus outer membrane; Single-pass type IV membrane protein; Cytoplasmic side. Sarcoplasmic reticulum membrane {ECO:0000250}; Single-pass type IV membrane protein {ECO:0000250}. Cell membrane; Single-pass membrane protein. Cytoplasm, cytoskeleton. Mitochondrion {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Note=Different isoform patterns are found in the different compartments of the cell. The isoforms having the C-terminal transmembrane span can be found in several organellar membranes like the nuclear envelope, the sarcoplasmic reticulum of myoblasts, or the lamellipodia and focal adhesions at the cell membrane. The largest part of the outer nuclear membrane- associated protein is cytoplasmic, while its C-terminal part is associated with the nuclear envelope, most probably the outer nuclear membrane. Remains associated with the nuclear envelope during its breakdown in mitotic cells. Shorter solubles isoforms can be found in the cytoplasm and within the nucleus (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | C-terminal isoforms are highly expressed in the brain, hert and skeletal muscle. Isoform 1 (Nesprin-2 Giant) is most prevalent in the brain, skin, kidney and skeletal muscle. {ECO:0000269PubMed:18477613}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2449316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001715
Calponin homology domain IPR002017 Spectrin repeat IPR012315 KASH domain IPR018159 Spectrin/alpha-actinin IPR022613 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein, CH domain |
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PFAM |
PF00307
PF00435 PF10541 PF11971 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00033
SM00150 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6ZWQ0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6ZWQ0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6ZWN0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 319565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.402320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001005510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Syne2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC115714 AC159897 AC164121 AC166991 AK052521 AK084394 BC082586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH82586 BAC35023 BAC39173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||