Mus musculus Protein: Puf60 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-152637.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Puf60 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | poly-U binding splicing factor 60 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410104I19Rik; 2810454F19Rik; SIAHBP1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000002599 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-152633 (Puf60) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | DNA- and RNA-binding protein, involved in several nuclear processes such as pre-mRNA splicing, apoptosis and transcription regulation. In association with FUBP1 regulates MYC transcription at the P2 promoter through the core-TFIIH basal transcription factor. Acts as a transcriptional repressor through the core-TFIIH basal transcription factor. Represses FUBP1-induced transcriptional activation but not basal transcription. Decreases ERCC3 helicase activity. Is also involved in pre-mRNA splicing. Promotes splicing of an intron with weak 3'-splice site and pyrimidine tract in a cooperative manner with U2AF2. Involved in apoptosis induction when overexpressed in HeLa cells. Modulates alternative splicing of several mRNAs. Binds to relaxed DNA of active promoter regions. Binds to the pyrimidine tract and 3'- splice site regions of pre-mRNA; binding is enhanced in presence of U2AF2. Binds to Y5 RNA in association with TROVE2. Binds to poly(U) RNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Note=Colocalizes partially with TROVE2. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 81 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1915209 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR006532 Poly-U binding splicing factor, half-pint |
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PFAM |
PF00076
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00361 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3UEB3 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q3UEB3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67959 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29965 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_598452 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Puf60 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37111 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK149632 AK151526 AK168789 BC010601 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH10601 BAE28998 BAE30474 BAE40622 | ||||||||||||||||||||||