Mus musculus Protein: Prdm5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-153276.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prdm5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PR domain containing 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4432417F03Rik; 6530401I24Rik; AI197291; E130112L17Rik; PFM2; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000031976 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153270 (Prdm5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Sequence-specific DNA-binding transcription factor. Represses transcription at least in part by recruitment of the histone methyltransferase EHMT2/G9A and histone deacetylases such as HDAC1. Regulates hematopoiesis-associated protein-coding and microRNA (miRNA) genes (By similarity). May regulate the expression of proteins involved in extracellular matrix development and maintenance, connective tissue components and molecules regulating cell migration and adhesion. May caused G2/M arrest and apoptosis in cancer cells (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1918029 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR017125 PR-domain zinc finger protein PRDM5 |
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PFAM |
PF00856
PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037162
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SMART |
SM00317
SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9CXE0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 70779 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.263355 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_081823 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prdm5 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20208 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK014501 BC138901 BC138902 CH466523 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI38902 AAI38903 BAB29400 EDK98780 | ||||||||||||||||||||||