Mus musculus Protein: Rnf4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-155020.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf4 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ring finger protein 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU018689; Gtrgeo8; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000030992 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155018 (Rnf4) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase which binds polysumoylated chains covalently attached to proteins and mediates 'Lys-6'-, 'Lys-11'-, 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked polyubiquitination of those substrates and their subsequent targeting to the proteasome for degradation. Regulates the degradation of several proteins including PML and the transcriptional activator PEA3. Involved in chromosome alignment and spindle assembly, it regulates the kinetochore CENPH-CENPI-CENPK complex by targeting polysumoylated CENPI to proteasomal degradation. Regulates the cellular responses to hypoxia and heat shock through degradation of respectively EPAS1 and PARP1. Alternatively, it may also bind DNA/nucleosomes and have a more direct role in the regulation of transcription for instance enhancing basal transcription and steroid receptor- mediated transcriptional activation. {ECO:0000269PubMed:20681948}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Nucleus, PML body {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | In the embryo, expressed primarily in the developing nervous system with strong expression in the dorsal root ganglia and gonads. Ubiquitously expressed in the adult. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 35 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1201691 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9QZS2 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9QZS2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R2C9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 19822 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.470513 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006503866 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rnf4 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS57336 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC102620 AC104889 AF169300 AK019171 AK090162 AK145596 AK147057 AK151116 AK158987 AK159778 AK159949 BC003282 U95141 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC53539 AAF00620 AAH03282 BAB31585 BAC41119 BAE26531 BAE27641 BAE30125 BAE34757 BAE35362 BAE35505 | ||||||||||||||||||||||