Mus musculus Protein: Syngap1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-156095.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syngap1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000080038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156093 (Syngap1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Major constituent of the PSD essential for postsynaptic signaling. Inhibitory regulator of the Ras-cAMP pathway. Member of the NMDAR signaling complex in excitatory synapses, it may play a role in NMDAR-dependent control of AMPAR potentiation, AMPAR membrane trafficking and synaptic plasticity. Regulates AMPAR- mediated miniature excitatory postsynaptic currents. Exhibits dual GTPase-activating specificity for Ras and Rap. May be involved in certain forms of brain injury, leading to long-term learning and memory deficits (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}. Cell junction, synapse {ECO:0000250}. Note=Mostly in excitatory glutamatergic synapses (By similarity). receptor activation or SYNGAP1/MPDZ complex disruption. Phosphorylation by PLK2 promotes its activity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:3039785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000008
C2 domain IPR001849 Pleckstrin homology domain IPR001936 Ras GTPase-activating protein IPR008936 Rho GTPase activation protein IPR021887 Protein of unknown function DUF3498 |
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PFAM |
PF00168
PF00169 PF00616 PF12004 |
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PRINTS |
PR00360
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00239
SM00233 SM00323 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | F6SEU4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-XP_990642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 240057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.328888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001268420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Syngap1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC144621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||