Mus musculus Protein: Amica1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-159200.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Amica1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000052033 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-159198 (Amica1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Transmembrane protein of the plasma membrane of leukocytes that control their migration and activation through interaction with CXADR, a plasma membrane receptor found on adjacent epithelial and endothelial cells. The interaction between both receptors mediates the activation of gamma-delta T-cells, a subpopulation of T-cells residing in epithelia and involved in tissue homeostasis and repair. Upon epithelial CXADR-binding, AMICA1 induces downstream cell signaling events in gamma-delta T- cells through PI3-kinase and MAP kinases. It results in proliferation and production of cytokines and growth factors by T- cells that in turn stimulate epithelial tissues repair. It also controls the transmigration of leukocytes within epithelial and endothelial tissues through adhesive interactions with epithelial and endothelial CXADR. {ECO:0000269PubMed:20813954}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:20813954}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:20813954}. Cell junction {ECO:0000250}. Note=Localized at the plasma membrane and enriched in areas of cell-cell contacts. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed by gamma-delta intraepithelial T cells (at protein level). {ECO:0000269PubMed:20813954}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2685484 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003596
Immunoglobulin V-set, subgroup IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin |
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PFAM |
PF07679
PF07686 PF00047 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00406
SM00408 SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80UL9 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q80UL9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 270152 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.190461 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001005421 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3MJ9 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Amica1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23128 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC122305 AY093688 BC050133 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH50133 AAM15732 | ||||||||||||||||||||||